・「遺伝子の運動を支配する物理法則：物理学の視点から生命現象を研究する」
 　 坂上貴洋
　　青山学報281号

・「環状高分子間の貫通に対するパーシステントホモロジー」
 　 中村壮伸、坂上貴洋
　　日本物理學會誌 2022年77巻８号

・「高分子系における異常拡散現象」
　　坂上貴洋
　　分子シミュレーション研究会会誌　"アンサンブル", 18(3),149-154 (2016/July).

・「自然世界の高分子 --- 物理現象から生命の起源まで ---」
　　田中基彦、鴇田昌之、柳澤美穂、坂上貴洋、藤原慶
　　吉岡書店　2016年3月　（総ページ数372）
　　(Giant Molecules: Here, There, and Everywhere, A.Y. Grosberg and A.R. Khokhlovの翻訳)

・「紐状分子の非平衡ダイナミクス：細孔通過現象を中心に」
 　 坂上貴洋、齋藤拓也
　　日本物理學會誌 2012年10月号

・"Self- organization and Dynamics of Active Matter" -研究会の私的会議録、雑感、その他-
　 竹内一将、及川典子、稲垣紫緒、坂上貴洋、和田浩史
　 物性研究　2009年12月

 
 ・「ナノバイオロジー」
    坂上　貴洋、　吉川　研一, 竹安邦夫　編、共立出版　(2004)
    第六章「ナノシミュレーション  nano-physicsからnano-biologyへ」

・「分子の紐の折り畳み
　 坂上　貴洋, 特集：「DNA:紐の物理」-分子情報から時空構造へのシナリオ-　
   数理科学（サイエンス社）,2002年6月号No. 468